第01話「還流～密室の昏迷」
・亀山薫が訪れた東南アジアの国サルウィン・・・
・杉下右京と亀山薫が大河内春樹から指導された会議室・・・川崎マリエン
・杉下右京と亀山薫が小野田公顕に呼ばれた写真展示会場・・・
・瀬戸内米蔵先生を励ます会の会場・・・
センチュリーパレス東京のフロント、ロビー・・・シェラトン都ホテル東京
・兼高が死んでいたホテル外観・・・プリンセスガーデン
・亀山薫が同窓会した旅館・・・元湯 玉川館
・衆議院会館・・・茨城県市町村会館
・警視庁地下駐車場・・・さいたまスーパーアリーナ
・NGO PELICANがあるビル・・・江原ビル（千代田区神田司町2丁目21-4）
・サルウィン日本大使館外観・・・
・サルウィン日本大使館のダイニングルーム・・・メゾンポール・ボキューズ
・光話大学病院・・・埼玉精神神経センター
小笠原雅之と田坂晋一が勤める富司商事・・・ThinkPark Tower
・ホームレスがカバンを見つけた場所・・・百人町一丁目歩道橋下（東京都新宿区百人町1丁目25）
第02話「還流～悪意の不在」
・亀山薫が歩いていたトンネル・・・青山トンネル（東京都渋谷区渋谷4丁目）
・救援物資が送られたシンガポールの港・・・
・新聞が売られていた場所・・・
・小笠原雅之が兼高公一からの電話を受け取った富司商事非鉄金属部のオフィス・・・
・瀬戸内米蔵と小笠原雅之がいたバー・・・
・杉下右京と亀山薫と瀬戸内米蔵を乗せたヘリが降りたヘリポート・・・浦安ヘリポート
第03話「沈黙のカナリア」
・胡蝶蘭を乗せた軽のバンが走っていた通り・・・国会議事堂前の道
・衆議院議員会館・・・茨城県市町村会館
・内村莞爾ら警視庁上層部の人たちが会議していた会議室・・・川崎マリエン
・伊丹健一と芹澤慶二が訪れた工事現場・・・
・伊丹健一と芹澤慶二が訪れた最初のネットカフェ・・・らくだ秋葉原店（東京都千代田区外神田1丁目3-7）
・捜一トリオが訪れたネットカフェ・・・アイ・カフェAKIBA PLACE店（東京都千代田区外神田3丁目）
・松岡京介と後藤新次が乗った車が走っていた通り・・・都道443号（東京都練馬区光が丘7丁目）
・後藤邸・・・
・杉下右京と亀山薫が松本京介から話を聞いた公園・・・国会前庭
・胡蝶蘭が爆発したバー・・・
・松本京介が子供の頃に住んでいた炭坑町の家・・・
第04話「隣室の女」
・遺体が見つかった山林・・・
・杉下右京と亀山薫が訪れた岸あけみが勤めていたスナック・・・スナックパッション（東京都三鷹市下連雀3丁目22?9）
・岸あけみが昔住んでいたマンションあった土地にできたビル・・・新明和上野ビル（東京都台東区東上野5丁目16-5）
・警視庁奥沢警察署・・・川崎市役所第二庁舎（神奈川県川崎市川崎区砂子1丁目9-3）
・杉下右京と亀山薫が訪れた岸あけみが勤めていた会社・・・東京木場製材協同組合（東京都江東区新木場2丁目14-14）
・横山時雄が働いていたビル・・・川崎市役所本庁舎
・福井陽一が住んでいるマンション・・・
・杉下右京と亀山薫が岸あけみに話を聞いた公園・・・三原台公園（東京都練馬区三原台3丁目5-12）
・岸あけみが息子を迎えに行った保育所・・・キンダーナーサリー市川行徳園
第05話「顔のない女神」
・木下肇が住んでいるアパート・・・
・ラジオ局「JP-Station」が入っているビル・・・コンワビル（東京都中央区築地1丁目12-22）
第06話「希望の終盤」
・龍馬戦が開かれていた青梅の寿々屋旅館・・・あつぎ飯山温泉「元湯旅館」（神奈川県厚木市飯山4916）
・西片幸男が倒れていたビル・・・湯河原町 娯楽民宿「杉の宿」（神奈川県足柄下郡湯河原町鍛冶屋923-3）
・杉下右京と亀山薫が大野木亮を訪ねに行った将棋サロン・・・立川将棋サロン龍（東京都立川市錦町1丁目7-20）
・将棋会館・・・東京将棋会館（東京都渋谷区千駄ケ谷2丁目39-9）
・将棋新聞社・・・
・杉下右京と亀山薫が畑一樹から話を聞いたカフェ・・・オクターブ（東京都杉並区善福寺4丁目2-4）
第07話「最後の砦」
・連続スクーター通り魔事件で高梨加奈が襲われた場所・・・
・辻正巳が住むマンション・・・神奈川県横浜市青葉区千草台
・警視庁北川警察署・・・敬心学園 臨床福祉専門学校（東京都江東区塩浜2丁目22-10）
・杉下右京と小野田公顕がお好み焼きを食べていた店・・・Kirara風月渋谷店
杉下右京と亀山薫が高梨加奈に話を聞きに行った公園・・・築地川銀座公園（東京都中央区築地4丁目1）
・杉下右京と亀山薫があるいていた通り・・・敬心学園 臨床福祉専門学校前付近（東京都江東区塩浜2丁目22）
・杉下右京と亀山薫が野村修司に話を聞いた屋上・・・敬心学園 臨床福祉専門学校屋上（東京都江東区塩浜2丁目22）
・杉下右京が野村修司と話をしていた東京タワーが見える公園・・・芝公園 4号地（東京都港区芝公園3丁目2）
第08話「レベル4～前篇」
・亀山薫がランニングしていた公園・・・国会前庭
・国立微生物研究所・・・埼玉県立大学
・小菅彬が長峰千沙子に電話をかけた公園の橋・・・公園小橋（東京都新宿区西新宿2丁目10）（35°41’16.4″N 139°41’25.1″E）
・伊丹健一と芹澤慶二が小菅彬を見つけ追いかけた場所・・・角筈橋（東京都新宿区西新宿3丁目6）（35°41’12.6″N 139°41’28.2″E）
・小菅彬が杉下右京に電話した場所・・・東映東京撮影所西門
・杉下右京と亀山薫が小菅彬に会いに向かった東葉新線山砥駅・・・東葉高速鉄道八千代緑が丘駅
・小菅彬が降りた駅・・・東葉高速鉄道村上駅
・小菅彬が隠れ家として使っていた倉庫・・・セレブリティークルーズ（神奈川県横浜市神奈川区守屋町1丁目2-5）
第09話「レベル4～後篇・薫最後の事件」
・ウィルスに感染した捜査員たちが運ばれた逓信大学中央病院・・・和光市役所
・杉下右京と亀山薫の車が走っていた通り・・・南通り
・防衛省外観・・・防衛省
・伊丹憲一がタバコを吸っていたビル・・・社会文化会館
・杉下右京と小野田公顕が歩いていた通り・・・国会前庭の南側の歩道
・亀山薫が杉下右京からの電話を受けたガード下・・・青山トンネル（東京都渋谷区渋谷4丁目）
・杉下右京が亀山薫に電話した公園・・・国会前庭
第10話「ノアの方舟～聖夜の大停電は殺人招待状!」
・捜一トリオが張り込んでいたアジト・・・
・小野田公顕が瀬田宗明を待っていた場所・・・神宮外苑のいちょう並木（東京都港区北青山1丁目）
・瀬田和哉が勤めていた帝都大学・・・東京薬科大学
・法務大臣室・・・
・杉下右京と姉川聖子が訪れた瀬田和哉のマンション・・・
・杉下右京と姉川聖子が乗った車が走っていた通り・・・国道20号線（甲州街道）
・停電事件の犯行現場のマンホールの場所・・・高崎市 下水道局維持管理課（群馬県高崎市高松町35-1）（36°19’22.0″N 139°00’09.5″E）
・帝都大学・・・東京薬科大学
・菱河コーポレーション・・・山野美容専門学校
・強制捜査が入ったテロリストジャッカロープのアジトがあるマンション・・・東京都練馬区東大泉2丁目
・爆弾テロの対象と思われた北新宿駅・・・東葉高速鉄道北習志野駅
・姉川聖子がパーティーの招待状を調べに入ったホテル・・・ホテルコンチネンタル横浜
・姉川聖子が向かった大桟橋埠頭・・・横浜港大さん橋国際旅客ターミナル
・菱河コーポレーション主催のテロリストが乗り込んだと思われるパーティーが行われる船・・・ロイヤルウィング
・30年前、四国に菱川石油化学の工場があった場所・・・足尾銅山跡（栃木県日光市足尾町）
・野上昶が子供の頃住んでいた村・・・栃木県日光市足尾町南橋
・30年前、瀬田宗明弁護士事務所が入っていたビル・・・第2井上ビル（東京都中央区日本橋茅場町2丁目）
野上昶が瀬田和哉を連れて行った浄水場・・・阿久津水処理センター（群馬県高崎市阿久津町730）
・野上昶がいた墓地・・・集団墓地（栃木県日光市足尾町中才８）
・最後、杉下右京と姉川聖子がいた公園・・・国会前庭
第11話「越境捜査」
・長嶺修が逃げたアパート・・・神奈川県横浜市青葉区千草台
・藤堂亜里沙ちゃんが誘拐された路地・・・
・藤堂邸・・・神奈川県横浜市都筑区中川7丁目
・中谷邸・・・神奈川県川崎市麻生区虹ケ丘1丁目
・ローラー作戦がとられた川崎市緑ヶ丘の住宅街・・・神奈川県川崎市麻生区細山6丁目
・角田六郎が杉下右京のメールを確認した時に車が走っていた橋・・・関戸橋（東京都多摩市関戸）
・藤堂俊作が運転する車が走っていた通り・・・新港サークルウォーク東側（神奈川県横浜市中区新港1丁目4）
・藤堂俊介の車が停まった赤レンガ倉庫・・・横浜赤レンガ倉庫東側
・5億円を乗せた車を盗んだ男が走っている通り・・・国際大通り（神奈川県横浜市西区みなとみらい2丁目3）（35°27’25.4″N 139°38’09.3″E）
・身代金を盗んだ男が確保された場所・・・神奈川県横浜市西区みなとみらい3丁目
第12話「逃亡者」
・転落事件があった跨線橋・・・囲桃園跨線橋（東京都中野区中野4丁目15）
・警視庁田町警察署・・・
・マルコ・イノウエが働いていたバー・・・GASPANIC BAR（東京都港区六本木3丁目15）
杉下右京が入ったエリ・コバヤシの雑貨屋・・・チチカカ渋谷店（東京都渋谷区宇田川町6-20）
・杉下右京と小野田公顕が回転寿司を食べに行った店
・マルコ・イノウエの遺体が見つかった場所・・・東映東京撮影所
・杉下右京と小野田公顕がいたオープンテラスのカフェ・・・日比谷茶廊
・志茂川真が帰国した空港・・・成田国際空港第2ターミナル
第13話「超能力少年」
・計銀杏銀座警察署・・・東映東京撮影所
・強盗が入った銀座のコンパル通りのクラブ・・・
・縄手邸・・・Pia4 阿佐ヶ谷（東京都杉並区阿佐ヶ谷南1丁目26-12）
・杉下右京が斎木敏也から話を聞いた公園・・・築地川公園（東京都中央区明石町10番2号）
・杉下右京が訪れた芦田真紀が住んでいるマンション・・・
・杉下右京が斎木敏也から話を聞いた食堂・・・きくよし食堂（東京都府中市緑町3丁目17-5）
・杉下右京と米沢守が縄手拓海を待っていた公園・・・
・捜索した池のある久我山公園・・・府中の森公園の日本庭園（東京都府中市浅間町1丁目3）
・米沢守と縄手拓海が歩いていたら、縄手拓海がお告げを聞いた住宅街・・・
・強盗が入ると予知されたコンビニ・・・生活彩家 神田錦町店（東京都千代田区神田錦町3-15）
・窃盗犯が入った不動産屋「キャッスルエステイト」・・・
・杉下右京と米沢守が防犯カメラについて話をしていた場所・・・東京都千代田区神田錦町3丁目（35°41’29.5″N 139°45’44.1″E）
・米沢守が盗聴器を探していた住宅街・・・
・坂本明が住んでいるアパート「さつき荘」・・・
第14話「男装の麗人」
・山際昌子のマンション・・・神奈川県川崎市麻生区はるひ野4丁目
・ヤマギワ プランニングのオフィス・・・オフィス設計
・荊城紫雨のスタジオ・・・スタジオ・クオーレ
・荊城紫雨のマンション・・・
・帝都歌劇場・・・府中の森芸術劇場
・佐々木邸・・・
・荊城紫雨が佐々木を問い詰めた水際の公園・・・舟渡水辺公園
・荊城紫雨と富岡史恵が教室の話をしていた喫茶店・・・東映東京撮影所
第15話「密愛」
・宇佐美邸・・・スタジオムーンニンフ（茨城県守谷市高野1858-2）
・杉下右京が榊敏郎について聞き込みをした布団店・・・あさひや（東京都板橋区中板橋21-3）
・宇佐美悦子が教えていた大学の講義室・・・駿河台大学
・榊の妻が経営していた宝飾店・・・カワヒト（東京都板橋区中板橋22-5）
・宇佐美悦子が榊敏郎を偶然に見た場所・・・吉田謙受堂（埼玉県川越市連雀町13-8）
・榊敏郎が男と話をしていた喫茶店・・・シマノコーヒー大正館（埼玉県川越市連雀町13-7）
第16話「髪を切られた女」
・芹沢慶二が参列した三村奈津子の葬儀場・・・
・三村奈津子が住んでいたマンション・・・砧サンハイム（東京都世田谷区砧5丁目20-19）
・三村奈津子が働いていた文光印刷会社・・・
・共映東京撮影所・・・東映東京撮影所
・杉下右京と芹澤慶二が訪れた文化庁外観・・・文化庁（東京都千代田区霞が関3丁目2-2）
・杉下右京と芹澤慶二が文化庁の職員から話を聞いた会議室・・・クロスウェーブ府中
・杉下右京と芹澤慶二が聞き込みに行った川島敏夫が通っていたバー・・・
・川島敏夫と三村奈津子が会っていた喫茶店・・・バンフ（東京都練馬区大泉学園町3丁目）
・杉下右京が川島敏夫の映画を見た試写室・・・
第17話「天才たちの最期」
・城戸幸四郎ゼミ卒業制作作品朗読会の会場・・・彩の国さいたま芸術劇場小ホール
・東都芸術大学・・・駿河台大学
・柘植瑛子と堀江恵一が勤める時創舎・・・堀井ビル（東京都千代田区神田三崎町3丁目10-10）
・昔、梅津朋美が盗作呼ばわりされた想文社・・・丸の内東映会館（東京都中央区銀座3丁目2-17）
・五十嵐邸・・・旧安田楠雄邸庭園
・杉下右京と柘植瑛子が会ったカフェ・・・ピエトロコルテ大泉学園店
・梅津朋美と堀江恵一が会った喫茶店・・・コーヒーハウスるぽ
・安原慎一が育った聖マリア児童園・・・東京テモテ教会
・柘植瑛子が訪れていた印刷会社・・・三映印刷（東京都練馬区貫井4丁目1-7）
・杉下右京と柘植瑛子が歩いていた通り・・・国会前庭の南側の通り
第18話「悪意の行方」
・杉下右京が襲われたガード下・・・港町架道橋（東京都港区海岸1丁目3）（35°39’11.7″N 139°45’24.3″E）
・杉下右京と陣川公平が監禁されていた船がある場所・・・亀島川の停泊所（東京都中央区湊１丁目８）（35°40’25.5″N 139°46’49.4″E）
・伊藤真央が教えている真清学園中学校・・・
・陣川公平と久保田優子が歩いていた通り・・・中央通り京王プラザホテル前（東京都新宿区西新宿2丁目2）
・五味勇一郎が住むアパート・・・
・陣川公平が住んでいるマンション・・・東京都中野区本町3丁目
・八木下卓也が通う区立田川西中学校・・・豊島区役所西部区民事務所
・陣川公平がタクシーで久保田優子を送って行った場所・・・
・久保田優子が勤めるBuraiが入っているYAWATAビル・・・住友ケミカルエンジニアリング（千葉市美浜区中瀬1丁目7番1）
・杉下右京と陣川公平が久保田優子に話を聞いた場所・・・青海南埠頭公園（東京都江東区青海2丁目）
第19話最終回2時間スペシャル「特命」
・山口値弓、毅一が住んでいる家・・・
・神戸尊が特命係に任命された会議室・・・川崎マリエン
・殺人事件があったマンション・・・
・神戸尊が馬頭刈村に向かう途中に渡った赤い橋・・・宮ヶ瀬湖の仏果沢橋
・神戸尊が馬頭刈村に向かう途中に渡った白い橋・・・宮ヶ瀬湖の七曲橋
・馬頭刈村に向かう神戸尊が車をUターンほどに左折させた橋・・・日之出橋（埼玉県飯能市上畑）（35°50’30.2″N 139°16’48.6″E）
・小池福助が横たわっていた場所・・・
・小池源一の家・・・
・杉下右京が泊っている柊荘・・・七沢温泉 元湯玉川館
・杉下右京が歩いて渡った橋・・・名栗川橋（埼玉県飯能市下名栗）（35°51’37.8″N 139°11’18.4″E）
・馬頭刈村駐在所・・・
・山口直弓が行った神社・・・
・舟木医院・・・
・山口直弓が墓参りしていた墓地・・・（35°51’35.6″N 139°11’17.0″E）
・杉下右京が訪ねた法春の寺・・・楞厳寺（埼玉県飯能市下名栗874番地）
・休憩小屋があった場所・・・
・杉下右京が小池福助に話を聞きに行った馬頭刈村展望台・・・中間平緑地公園（埼玉県大里郡寄居町秋山）
・小池福助が小池貞子に電話をした場所・・・大泉学園駅前遊歩道（東京都練馬区東大泉5丁目）
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