放送日：2008年10月22日～2009年3月18日
第01話「還流～密室の昏迷」
2008年10月22日放送
警視庁特命係の杉下右京（水谷豊）と亀山薫（寺脇康文）は小野田（岸部一徳）に誘われ、代議士・瀬戸内（津川雅彦）の政治資金集めのパーティーに連れていかれる。そのホテルで偶然、高校時代の友人でNGOスタッフとして海外で活動している兼高（四方堂亘）を見かける薫。部屋を訪ねるが留守のためメモを残していくのだが…。ひとつの事件がきっかけで世界に波及し、意外な巨悪を暴き出す！ 真相を掴みに灼熱のアジアへ向かう！
ゲスト： 津川雅彦、西岡徳馬
相棒Season07 第01話「還流～密室の昏迷」
第02話「還流～悪意日の不在」
2008年10月29日放送
殺害された兼高（四方堂亘）の手帳にあった『シンガポール 空』は何を意味するのか!? 右京（水谷豊）はシンガポールという地名と容疑者の小笠原（西岡徳馬）が貿易関係の仕事をしていることからある推理を組み立てる。小笠原の部下・田坂が逃亡先のスイスで拘束され、黙秘し続けていた小笠原はついに薫（寺脇康文）に真実を語る！ 驚愕のその内容とは！？ 小笠原はなぜ兼高を殺害したのか？そしてその裏で暗躍した意外な人物とは？ 善意と巨悪が交錯する渾身の第２話!!
ゲスト： 津川雅彦、西岡徳馬
相棒Season07 第02話「還流～悪意日の不在」
第03話「沈黙のカナリア」
2008年11月5日放送
議員会館の後藤新次議員（大沢健）の事務室で爆弾が爆発、政策秘書の中村（磯辺勉）が死亡した。厚生労働省の大臣政務官に就任したばかりの後藤。どうやら爆弾は祝いの贈り物にまぎれて送り付けられたらしい。だとしたら、あのチェックの厳しい議員会館をどうやって爆弾は通り抜けたのか？疑問を抱いた右京（水谷豊）は薫（寺脇康文）とともに現場へ。右京はその巧みなトリックを見抜くが…。テロか、怨恨か。事件に隠された真実とは？
ゲスト：眞島秀和、大沢健、磯部勉
相棒Season07 第03話「沈黙のカナリア」
第04話「隣室の女」
2008年11月12日放送
６年前に失踪した男の白骨化した遺体が発見された。かつてこの男と不倫関係にあったあけみ（佐藤仁美）が容疑者として浮上するが、凶器に残された指紋が一致しない。しかし、その証言に些細な疑問を抱いた右京（水谷豊）は薫（寺脇康文）とともに捜査へ乗り出す。すると、あけみが勤めていたスナックのママから興味深い証言を得る。さらにかつてあけみが住んでいたマンションではある奇妙な事件が起きていた…。６年前の殺人事件との関係は？右京と薫が見た真実とは？
ゲスト：佐藤仁美
相棒Season07 第04話「隣室の女」
第05話「顔のない女神」
2008年11月19日放送
ラジオ局の目の前で人気DJ西田春香がストーカーらしい男に刺殺された。右京（水谷豊）と薫（寺脇康文）はプロデューサーの佐久間から本来の休みのはずの春香が今日、出社していることも知らなかったと聞かされる。ストーカーにしては内部事情に詳し過ぎる。春香が、10年間続いた伊沢ローラ（清水美沙）の後番組を担当することになっていたことがわかった。右京らはローラから話を聞くが…。ストーカー犯罪に隠されたトリック、意外なラジオ局の人間関係に右京らが迫る！
ゲスト：清水美沙
相棒Season07 第05話「顔のない女神」
第06話「希望の終盤」
2008年11月26日放送
将棋のタイトル戦を戦っていた棋士・西片（水橋研二）の遺体が最終局の朝に発見された。ひどく荒らされた西片の部屋を調べた右京（水谷豊）と薫（寺脇康文）は、犯人が将棋に詳しい人間ではないか、と疑いを抱く。事件当夜、賭け将棋で生活する真剣師・大野木（松田賢二）が西片を訪ねてきていたことがわかった。大野木はプロ棋士の養成機関・奨励会で西片と同期。将棋の観戦記者・畑（蟹江一平）も2人と同期だった。タイトル戦の裏に一体何が？チェスだけでなく将棋にも精通している右京の名推理ぶりは必見！
ゲスト：蟹江一平、水橋研二、松田賢二
相棒Season07 第06話「希望の終盤」
第07話「最後の砦」
2008年12月3日放送
スクーター通り魔事件の容疑者・辻（ひたたら）が野村警部補（金山一彦）による取り調べ中に急死した。どうやら野村の行き過ぎともいえる取り調べが原因らしいが、取調べ監督官の下柳（鈴木浩介）は問題なしと証言。上層部も事件を闇に葬ろうとする。小野田（岸部一徳）から事件を聞かされた右京（水谷豊）と薫（寺脇康文）は辻の遺体に不審な点を発見する。本当に辻は犯人だったのか？ 監督官制度導入に揺れる刑事たちの苦悩とは？そして真犯人は？
ゲスト：金山一彦、鈴木浩介
相棒Season07 第07話「最後の砦」
第08話「レベル4～前篇」
2008年12月10日放送
微生物研究所から殺人ウイルスが持ち出された。研究所の職員・千沙子（大路恵美）によると持ち出したのは小菅（袴田吉彦）でそのウイルスを生み出したのも小菅だという。右京（水谷豊）に小菅から挑戦的な電話がかかる。何をしたいのかとの右京の問いに「ゲームかな」と答える小菅。右京と薫（寺脇康文）は小菅の指示で駅へ向かうことに。右京と薫がついに小菅と対峙する！今まさに小菅のいう“ゲーム”が始まろうとしていた…。
ゲスト：袴田吉彦、大路恵美
相棒Season07 第08話「レベル4～前篇」
第09話「レベル4～後篇・薫最後の事件」
2008年12月17日放送
小菅（袴田吉彦）が仕掛けた爆弾がアジトで爆発！ 殺人ウイルスが漏れ出し米沢（六角精児）ら鑑識の数人が感染してしまう。病院の隔離病棟へと運び込まれた米沢は、そこで奇妙な行動をとる人物を目撃し右京へ電話で報告。直後に感染者の一人が苦しみ始めたため、右京（水谷豊）はある推論を立てる。これ以上の感染を防ぐべく、右京は薫（寺脇康文）に命をかけた依頼をする！ “逆転の発想”を利用した右京の意外な依頼とは！？ 命をかけた亀山薫最後の事件の結末は如何に！！
ゲスト：袴田吉彦、大路恵美
相棒Season07 第09話「レベル4～後篇・薫最後の事件」
第10話「ノアの方舟～聖夜の大停電は殺人招待状!」
2009年1月1日放送
羽田空港での爆破事件に続き、クリスマスイブの東京都心で大規模停電が発生した。そして、地球温暖化阻止を提唱する環境保護団体から犯行声明文が。日本初の“エコテロ”か？そんな折り、小野田（岸部一徳）が右京（水谷豊）のもとへ法務省官房長補佐官・姉川（田畑智子）を連れてやってくる。行方不明になっている瀬田法務大臣（渡哲也）の息子を隠密裏に探して欲しいという。どうやら環境テロとその息子に関係があるらしい。右京が探り当てたテロに隠された驚愕の事実とは？次なるテロの舞台は豪華客船に…！
ゲスト：渡哲也、田畑智子
相棒Season07 第10話「テレビ朝日開局５０周年記念
相棒～元日スペシャル
「ノアの方舟～聖夜の大停電は殺人招待状！狙われた法務大臣・次の標的は豪華客船？」
第11話「越境捜査」
2009年1月14日放送
角田（山西惇）課長らの捜査に協力した右京（水谷豊）は、拳銃を持った容疑者を追い、神奈川県警とともに住宅街で一軒一軒しらみつぶしに捜索することに。そのころ同じ住宅街の一角にある藤堂（五代高之）宅では、娘が誘拐され、神奈川県警の早川刑事（益岡徹）らが犯人と極秘裏に電話による駆け引きを行っていた。右京は藤堂の自宅に異変を感じ、やがてこのもうひとつの事件に首を突っ込むことになり…。右京が焙り出した真実とは？
ゲスト：益岡徹、五代高之
相棒Season07 第11話「越境捜査」
第12話「逃亡者」
2009年1月21日放送
女性の遺体が発見された。捜査に参加した所轄の左刑事（丸山智己）は、被害者女性の恋人・志茂川（山下徹大）を容疑者扱いし、伊丹（川原和久）と対立。女性が死の直前自ら110番通報していたことが判明。右京（水谷豊）はその録音テープからスペイン語を話す男女の微かな声を聞き取る。携帯電話に残された指紋からマルコという日系ルベルタ人が浮上。右京はマルコの元恋人のエリ（英玲奈）から事件の真相を聞き出すが、マルコはルベルタに帰国していた。犯罪人引渡条約の壁に阻まれた右京は小野田（岸部一徳）にある依頼をするが事件は意外な方向へと展開し…。
ゲスト：丸山智己、山下徹大、英玲奈
相棒Season07 第12話「逃亡者」
第13話「超能力少年」
2009年1月28日放送
予知能力のある子供・拓海が銀座のクラブに強盗が入ると予知した、と母親の順子（濱田マリ）が右京（水谷豊）のもとへやってきた。そのとおりに銀座のクラブで強盗殺人事件が発生する。突然、拓海にだけ聞こえてくる「お告げ」が未来の出来事を知らせるというのだが…。「お化けと超能力は信じていますよ」という右京は米沢（六角精児）とともに順子の自宅を調べるが…。少年の謎の超能力に右京がさらなる推理能力で挑む！
ゲスト：濱田マリ
相棒Season07 第13話「超能力少年」
第14話「男装の麗人」
2009年2月11日放送
帝都歌劇団員のパトロンとしても有名な女性社長が自室で死亡。心臓に疾患があり入浴後扇風機を消し忘れたことによる事故死と思われたが、右京（水谷豊）はちょっとした物証から別のモノが原因ではないかと推理し、殺人の可能性を指摘する。遺体を発見した元歌劇団員の紫雨（奥山佳恵）、同じく元歌劇団員のわたる、専務の矢橋らが怪しい。社員の史恵によると、社長は自宅で打ち合わせをすることも多かったとか。社長と彼女ら３人の間に何があったのか？
ゲスト：奥山佳恵
相棒Season07 第14話「男装の麗人」
第15話「密愛」
2009年2月18日放送
大学時代の恩師・悦子（岸惠子）に呼ばれ、彼女の山荘へとやってきた右京（水谷豊）。借金取りに追われ離れの小屋にかくまっていた榊（国広富之）が自殺したため、その身元を調べて欲しいと悦子から依頼されたからだ。しかし、右京は榊の死因は自殺ではなく他殺ではないかと言い始める。遺体を発見したとき小屋は密室状態だったのでそんなことはあり得ないという悦子に、自らの推理を語り始める右京。本当に殺されたのか？ ならばその犯人は誰なのか！？
相棒史上最高の一騎打ちがいま始まる！ 岸惠子の流暢なフランス語も見逃せない。
ゲスト：岸惠子、国広富之
相棒Season07 第15話「密愛」
第16話「髪を切られた女」
2009年2月25日放送
捜査一課の芹沢（山中崇史）がコソコソと特命係にやってきた。級友の同僚・奈津子が風呂で溺死したが連続髪切り殺人事件の犯人に殺害されたのではないかという。髪切り殺人犯は自殺したはずだが真犯人が別にいるという噂も騒がれていた。右京（水谷豊）は奈津子の死を芹沢と調べ直すことに。すると奈津子は事件当日、ベテラン映画監督の川島（秋野太作）と接触していたことがわかる。川島が髪切り殺人の真犯人なのか…。右京が“相棒”芹沢と奇妙な事件の真相に迫る！
ゲスト：秋野太作
相棒Season07 第16話「髪を切られた女」
第17話「天才たちの最期」
2009年3月14日放送
出版社の瑛子（黒川芽以）から再捜査の依頼を受ける右京（水谷豊）。詩人の青年・安原（三浦涼介）が朗読会の舞台上で衝撃の自殺をしたが瑛子は将来有望な彼に自殺はありえないという。右京は安原の師である城戸（中島久之）と詩壇の重鎮・五十嵐（西沢利明）に事情を訊くが…。さらに瑛子の上司・堀江（三上市朗）によって明かされる“もう一つの自殺”とは？ 詩壇のタブーに迫る右京の前に意外な真実が…!?
ゲスト：黒川芽以、中島久之、三上市朗、西沢利明、三浦涼介
相棒Season07 第17話「天才たちの最期」
第18話「悪意の行方」
2009年3月11日放送
右京（水谷豊）と元特命係の陣川（原田龍二）が何者かに拉致監禁された。現場には真央（金子さやか）という中学校教師の携帯電話が落ちていたが真央は学校裏サイトの管理人の生徒を退学に追い込んだことからその生徒から恨みを買っていた。そんな折り事件を通報し右京らを救った優子（原史奈）に陣川は一目ぼれ。今回も美人に弱い！？ 右京を監禁場所へと運んだ男が判明するが男は学校裏サイトで右京が襲われることを知ったという。なぜ特命係が学校裏サイトに？深まる謎に右京らは…。
ゲスト：原 史奈、金子さやか
相棒Season07 第18話「悪意の行方」
第19話最終回2時間スペシャル「特命」
2009年3月18日放送
警察庁の神戸尊（及川光博）という男が警視庁特命係に左遷されてくる！ 一体何をしでかして特命係に配属されることになったのか？一方、右京（水谷豊）は尊の配属初日、彼に会おうともせず、ある山奥の村で捜査をしていた。 出端をくじかれた尊は右京を追いかけるように村へ。右京によると、この村の女性から殺人事件を暗示するような絵が添えられた手紙が送られてきたという。 村長の源一（前田吟）、その弟の晋平（日野陽仁）、住職の法春（苅谷俊介）ら村の人間たちに煙たがられながらも捜査を進める右京と尊。描かれた絵の真相は？ 単なる描き手の想像か、それとも…？ 右京と尊の新コンビで初の事件に挑むに大苦戦!?
ゲスト：及川光博、前田吟、日野陽仁、苅谷俊介、宮本真希、伊嵜充則、やべきょうすけ
相棒Season07 第19話最終回2時間スペシャル「特命」
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